Tupakkakärpäs (bemisia tabaci) on maailmanlaajuisesti levinnyt haitallinen tuholainen, jolla voi olla vakavia vaikutuksia vihannesten tuotantoon. Sen kestävyys kasvinsuojelua vastaan on yksi käytännön vaikeuksista. Siksi resistenssigeenimutaatioiden havaitseminen voi tarjota tärkeän referenssin tuholaistorjuntaan. Yksittäinen Bemisia tabaci on kuitenkin pieni, sen rungon pituus on alle 1 mm. Perinteinen yhden pään sekvensointi on vaikeaa ja usein saadaan pieni määrä gDNA:ta, mutta se vie paljon aikaa ja resursseja, ja tieteellisessä tutkimuksessa tarvitaan kipeästi uusia havaitsemismenetelmiä.
© Tomasz Klejdysz | Dreamstime.com
Vihannestuholaistutkimuslaboratorio on kehittänyt menetelmän mikrohyönteisten geenimutaatioiden havaitsemiseksi amplikoniteknologialla ja havainnut kahden pyretroidiresistenssiin liittyvän natriumionikanavageenien pistemutaation esiintymistiheyden Bemisia tabaci -populaatiossa. Menetelmä on tehokas ja luotettava ja ratkaisee mikrohyönteisten geenimutaatiotaajuuden havaitsemisongelman.
Amplicon-sekvensointia käytettiin alun perin maaperän, kasvien tai eläinten suolistomikrobien yhteisökoostumuksen havaitsemiseen, jota voidaan käyttää analysoimaan mikrobien sekä eläinten ja kasvien välistä vuorovaikutusta. Amplikonisekvensointimenetelmä perustuu Next-Generation Sequencing -tekniikkaan, jolla on korkea sekvensointitehokkuus ja jolla voidaan suorittaa keskitetty havaitseminen suurelle määrälle näytteitä.
Ryhmä loi tehokkaan lähestymistavan mutaatioiden esiintymistiheyden havaitsemiseksi amplikonisekvensoinnilla. Tässä tutkimuksessa havaittiin L925I:n ja T929V:n esiintymistiheydet VGSC:ssä, jotka liittyvät pyretroidiresistenssiin, mikä voisi tarjota perustavaa tietoa B. tabacin resistenssin hallinnasta.
Tämä tutkimus tarjoaa tehokkaan ja luotettavan menetelmän mikrohyönteisten geenimutaatioiden toteamiseen ja auttaa kehittämään tuholaistorjuntaa kentällä. Tutkimus julkaistiin entomologian ammattilehdessä Pest Management Science (vaikutustekijä 3.75), Kiinan tiedeakatemian Q1. Väitöskirjan ensimmäinen kirjoittaja on Wei Yiyun, Laboratorion tutkijatohtori. Apulaistutkijat Wang Ran, tohtori Qu Cheng ja tohtori Guan Fang Nanjingin maatalousyliopistosta osallistuivat osaan työhön. Tutkija Luo Chen on paperin vastaava kirjoittaja.
Wei, Y., Guan, F., Wang, R., Qu, C. ja Luo, C. (2021), Amplicon-sekvensointi havaitsee mutaatiot, jotka liittyvät pyretroidiresistenssiin Bemisia tabacissa (Hemiptera: Aleyrodidae). Pest Manag
Julkaisupäivämäärä: